脚踝内侧肿疼可能由多种原因引起。比如运动损伤较为常见，像打篮球、跑步等运动中，突然的扭转或过度牵拉可能导致脚踝内侧的韧带损伤，这种情况在运动爱好者中时有发生。
一、外伤因素导致
1. 韧带拉伤： 当脚踝受到外力作用，比如崴脚时，内侧的韧带可能被过度拉伸甚至撕裂，就会出现肿疼。一般来说，轻度韧带拉伤可能在数周内逐渐恢复，但严重的韧带撕裂可能需要数周到数月的时间来康复。2. 骨折： 如果脚踝内侧受到较大外力撞击，有可能发生骨折，除了肿疼外，还可能出现明显的畸形、活动受限等情况。骨折的恢复时间根据骨折的严重程度不同差异较大，简单的裂缝骨折可能需要4 - 6周左右初步愈合，而复杂的骨折可能需要数月甚至更长时间。
二、炎症性疾病引发
1. 关节炎： 类风湿关节炎可能累及脚踝关节，导致内侧肿疼，这种疾病是一种自身免疫性疾病，会持续进展，如果不积极治疗，可能会逐渐破坏关节结构。痛风性关节炎也可能发作于脚踝内侧，通常是由于体内尿酸代谢异常，尿酸盐沉积在关节引起急性炎症，往往在夜间突然发作，疼痛较为剧烈。2. 腱鞘炎： 脚踝内侧的肌腱如果发生炎症，也会引起肿疼。比如跟腱周围炎，长时间的行走、跑步等运动可能诱发，炎症会导致肌腱周围组织肿胀、疼痛。
三、其他原因
1. 感染： 脚踝内侧皮肤如果有破损，细菌等病原体入侵可能引起感染，导致局部肿疼，还可能伴有红、热等表现。这种感染如果不及时处理，可能会加重，甚至引发全身感染症状。2. 肿瘤： 虽然比较罕见，但脚踝内侧也可能出现肿瘤，如骨肿瘤等，会逐渐引起肿疼，并且可能伴有肿块等表现。肿瘤导致的肿疼往往会持续加重，经过一般的对症处理效果不佳。