早上起来嘴巴苦可能由多种原因引起。比如口腔问题，像不注意口腔卫生，有龋齿、牙龈炎等，细菌滋生会产生苦味；还有胃肠道问题，例如胆汁反流性胃炎，胆汁反流进入胃，再反流到口腔就会导致口苦，这类情况在一些患者中比较常见，大约有10% - 20%的胃肠道疾病患者会出现晨起口苦伴随胆汁反流的情况。
口腔卫生因素
口腔清洁不到位：如果晚上刷牙不彻底，食物残渣残留，经过一晚上的发酵，就容易滋生细菌，产生异味，同时可能伴有口苦感觉。一般来说，每天至少要早晚各刷一次牙，每次刷牙时间不少于3分钟。口腔疾病影响：像牙龈炎患者，牙龈会红肿、出血，局部炎症会导致细菌滋生，进而引发口苦；龋齿患者，龋洞内容易积存食物碎屑，也会造成口腔异味和口苦。有口腔疾病的人需要及时就医治疗，牙龈炎患者可能需要进行洗牙等处理。
胃肠道问题导致
胆汁反流性胃炎：正常情况下，胆汁是从肝脏分泌后通过胆管进入十二指肠的，如果幽门括约肌功能失调，胆汁就会反流进入胃，甚至到达食管、口腔，从而引起口苦。患者可能还会伴有上腹部疼痛、烧心等症状。这类患者在饮食上要注意避免吃辛辣、油腻、刺激性食物，以免加重胆汁反流。消化不良：晚上吃得过多、过饱，或者吃了不易消化的食物，如高脂肪、高蛋白质食物，会导致胃肠蠕动减慢，食物在胃肠道内停留时间过长，容易产生异味，进而引起口苦。建议晚餐不要吃得过饱，七八分饱即可，而且要选择容易消化的食物。
其他因素所致
药物副作用：某些药物服用后可能会有口苦的副作用，比如抗生素中的甲硝唑等。如果正在服用可能导致口苦的药物，且口苦情况较为明显，可以咨询医生是否能调整用药。不良生活习惯：长期吸烟、酗酒的人，口腔和胃肠道环境容易受到影响，也容易出现晨起口苦。吸烟会使口腔环境变差，酗酒会刺激胃肠道，所以要尽量戒烟限酒。