嘴起疱疹主要是由单纯疱疹病毒引起的，其中约90%是由单纯疱疹病毒Ⅰ型（HSV-Ⅰ）导致。
病毒感染引发
原发性感染： 当人体首次感染单纯疱疹病毒时，就可能引发嘴部疱疹。比如儿童初次接触病毒后，更容易出现原发性的嘴疱疹情况。一般在感染后的1 - 2周内会出现症状，先是局部皮肤有灼热、刺痛感，随后出现成簇的小水疱。复发感染： 初次感染病毒后，病毒会潜伏在神经节内，当身体抵抗力下降时，如发热、过度疲劳、月经来潮等情况，病毒就会被激活，导致嘴疱疹复发。复发时症状通常比原发性轻，水疱往往出现在原来发病的部位附近。
身体抵抗力因素
免疫力低下人群： 像患有艾滋病、恶性肿瘤等疾病的人，或者长期使用免疫抑制剂的人，身体抵抗力较弱，更容易受到单纯疱疹病毒的侵袭，从而引发嘴起疱疹。例如，长期服用糖皮质激素的患者，由于药物抑制了免疫系统功能，嘴疱疹的发病几率会明显增加。疲劳熬夜人群： 长期熬夜、过度劳累会使身体处于应激状态，导致免疫力下降。比如连续熬夜加班后，很多人会发现嘴周围开始出现疱疹，就是因为疲劳让身体抵抗力降低，给了单纯疱疹病毒可乘之机。
环境与生活习惯因素
气候因素： 在气候比较潮湿、炎热的环境下，有利于单纯疱疹病毒的繁殖和传播，人们嘴起疱疹的几率会相对增高。比如在夏季高温多雨的季节，一些人就容易出现嘴部疱疹问题。饮食不均衡人群： 长期挑食、偏食，导致身体缺乏维生素B族等营养物质时，会影响皮肤黏膜的正常代谢，使皮肤黏膜的抵抗力下降，容易引发嘴起疱疹。例如，长期不吃蔬菜、水果的人，就可能因为维生素摄入不足而出现这种情况。