肝内胆管结石的治疗存在一定难度。其治疗方案会依据结石在胆道的位置以及大小来确定。
一、如果结石位置与大小适宜，可采用ERCP及EST进行治疗，这属于创伤极低的一种治疗方式，术后恢复速度很快。具体来说，ERCP即经内镜逆行胰胆管造影术，是将内镜插入十二指肠降部，寻找胰胆管开口，再经此开口插入造影导管注入造影剂，从而显示胰胆管的技术；EST即内镜下乳头括约肌切开术，是在ERCP的基础上进行的一种治疗手段。
二、要是结石较大，有时会运用内镜处理，且根据结石位置选择不同手术方案，相较于传统手术，这种方案的伤害较小。内镜处理结石是通过各种内镜设备，如胆道镜等，直接对结石进行操作，以达到去除结石的目的。
然而，有时候由于结石大小、胆道畸形或是胆道结石复发等情况，手术会面临很大难度，在这种情形下，手术规模会相应扩大，也就会带来一定的创伤。
总之，肝内胆管结石的治疗较为复杂，要综合多方面因素选择合适的治疗方案，同时要积极应对可能出现的各种困难情况。