肝内胆管结石的治疗存在一定难度，且治疗方案需根据结石在胆道的位置以及大小来确定。
一、如果结石位置与大小合适，可采用ERCP及EST治疗，这是创伤极低的一种方案，术后能快速恢复。ERCP（内镜逆行胰胆管造影）是将内镜插入十二指肠降部，寻找胰胆管开口的乳头，再经活检孔插入造影导管，注入造影剂进行X线检查的方法。EST（内镜下乳头括约肌切开术）则是在ERCP的基础上，通过内镜对乳头括约肌进行切开，以利于结石排出。
二、若结石较大，则有时会采取内镜处理，根据结石位置选择不同手术方案，这种方案较传统手术伤害低。内镜处理结石是通过内镜进入胆道，利用各种器械对结石进行处理，比如碎石、取石等操作。
三、然而有时因结石大小、胆道畸形或胆道结石复发等情况，会使手术难度大增，此时手术规模会扩大，也会带来一定创伤。比如结石过大可能难以通过常规方法取出，胆道畸形会增加手术操作的复杂性，结石复发则可能需要更彻底的处理方式。
总之，肝内胆管结石的治疗需综合多方面因素选择合适的方案，要充分考虑结石的具体情况以确保治疗效果和减少创伤。