尿路结石的形成与多种因素相关，其中尿液中某些成分浓度过高是重要原因之一，比如有研究显示，高钙尿症在尿路结石患者中占一定比例。
代谢异常因素
尿液成分异常：当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等物质浓度过高时，就容易析出形成结石。例如高钙尿症患者，尿液中钙含量超出正常范围，就增加了钙盐结石形成的风险；草酸摄入过多也会使尿液中草酸浓度升高，进而促进草酸钙结石形成。尿pH值改变：不同成分的结石对尿液pH值要求不同。比如尿酸结石常见于酸性尿中，而磷酸镁铵结石则多见于碱性尿中。当尿液pH值偏离正常范围时，相应成分就更易沉淀形成结石。
局部因素
尿路梗阻：尿路存在狭窄、肿瘤等情况时，会导致尿液排出不畅，尿液中的晶体物质就容易在局部沉积，长期积累就可能形成结石。像输尿管狭窄的患者，尿液通过受阻，结石发生的几率相对较高。尿路感染：一些细菌、真菌等病原体在尿路中生长繁殖时，会作为核心促使结石形成。比如变形杆菌等细菌能分解尿素，使尿液碱化，从而促进磷酸镁铵等结石的形成。
生活方式因素
饮水不足：如果每天饮水量少于1500毫升，尿液会浓缩，尿液中各种溶质的浓度相对升高，就容易析出形成结石。有调查发现，每天饮水少于1000毫升的人群，尿路结石发生率明显高于饮水充足的人群。饮食不当：长期高嘌呤饮食会使尿酸生成增多，增加尿酸结石形成风险，比如经常吃动物内脏、海鲜等；高草酸饮食也不利于健康，像菠菜、巧克力等食物草酸含量较高，长期大量食用会提高草酸钙结石发生概率。缺乏运动：长期缺乏运动的人，尿液中晶体物质更容易沉积，因为运动少会影响尿液的正常流动和排泄，使得结石形成的可能性增加。