肝功能异常的原因有多种。比如病毒性肝炎就是常见原因之一，像乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒等感染人体后，约有5% - 10%的慢性乙型肝炎患者以及大部分慢性丙型肝炎患者可能出现肝功能异常情况。
一、感染因素
1. 病毒性肝炎： 除了乙肝、丙肝，甲肝和戊肝也会导致肝功能异常。甲肝多是通过消化道传播，儿童和青少年感染甲肝后，部分人会出现肝功能指标如转氨酶升高等异常情况；戊肝在一些地区的散发或暴发疫情中较为常见，孕妇感染戊肝后病情往往较重，肝功能异常发生率也相对较高。2. 其他病原体感染： 细菌、寄生虫等感染也可能影响肝功能。比如伤寒杆菌感染，可引起肝细胞损害，导致肝功能异常；肝吸虫感染人体后，虫体在胆道系统寄生，会造成胆管炎症、梗阻等，进而影响肝脏功能，出现肝功能异常表现。
二、药物因素
1. prescription药物： 一些常见的药物可能引发肝功能异常。例如抗结核药中的异烟肼，约有10% - 20%的患者使用异烟肼后会出现无症状的转氨酶轻度升高，少数人可能出现明显的肝功能损害；抗生素中的四环素，大剂量使用时可能导致脂肪肝、肝功能异常，尤其在孕妇、老年人等人群中更易发生。2. 非prescription药物： 某些非处方的草药、保健品也可能对肝脏有影响。比如含有吡咯里西啶生物碱的草药，像千里光、款冬等，如果长期或大量服用，可能引起肝窦阻塞综合征，导致肝功能异常。
三、酒精因素
长期大量饮酒是导致肝功能异常的重要原因。一般来说，成人男性每天饮酒折合酒精量超过40克，女性超过20克，连续饮酒5年以上，就可能引发酒精性肝病，出现肝功能异常，表现为转氨酶升高、胆红素升高等，严重的还会发展为肝硬化、肝癌等。
四、自身免疫因素
自身免疫性肝炎： 这是一种由自身免疫反应介导的肝脏炎症性疾病，多发生于女性，发病年龄多在10 - 30岁和40 - 60岁两个年龄段。患者体内会产生针对自身肝脏细胞的抗体，攻击肝脏细胞，导致肝功能异常，如球蛋白升高、转氨酶显著升高等，病情若得不到控制，会逐渐进展为肝纤维化、肝硬化。