肝功能异常是指肝脏在受到各种致病因素影响后，其正常功能发生改变，常见原因有以下几类：
一、感染因素
病毒感染： 像乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒等嗜肝病毒感染是导致肝功能异常很常见的原因。例如，乙肝病毒感染后，病毒会在肝细胞内复制，引发机体的免疫反应，损伤肝细胞，从而引起肝功能指标异常，如转氨酶升高等，据统计，全球有相当数量的人群感染乙肝病毒。寄生虫感染： 某些寄生虫感染也会影响肝功能，比如肝吸虫感染。肝吸虫在胆道内寄生，会引起胆管炎症、胆道梗阻等，进而影响肝脏的正常代谢和功能，导致肝功能出现异常。
二、药物及化学物质因素
药物性肝损伤： 很多药物都可能引起肝功能异常，常见的如抗结核药异烟肼，部分人服用后可能出现肝损害，导致转氨酶升高、胆红素升高等。还有一些抗生素，像红霉素等，也有引发药物性肝损伤的可能。化学物质接触： 长期接触某些化学物质也会损害肝脏，例如长期接触四氯化碳、磷、有机磷等化学毒物，会直接损伤肝细胞，影响肝脏的正常结构和功能，导致肝功能出现异常情况。
三、自身免疫因素
自身免疫性肝病： 自身免疫性肝炎就是典型的由自身免疫因素引起的肝功能异常疾病。患者自身的免疫系统错误地攻击肝细胞，导致肝细胞炎症坏死，出现肝功能指标异常，如球蛋白升高等，这种疾病在某些人群中发病率有上升趋势。原发性胆汁性胆管炎： 也是自身免疫介导的胆管损伤性疾病，机体的免疫系统攻击胆管上皮细胞，导致胆管破坏、胆汁淤积，进而影响肝脏的胆汁排泄功能，引起肝功能异常，患者会出现黄疸、瘙痒等症状。
四、代谢性因素
脂肪肝： 尤其是非酒精性脂肪肝，与肥胖、高脂饮食、缺乏运动等因素密切相关。当肝脏内脂肪堆积过多时，会影响肝细胞的正常代谢和功能，导致肝功能异常，比如转氨酶轻度升高，据统计，在肥胖人群中脂肪肝的患病率较高。肝豆状核变性： 这是一种先天性铜代谢障碍性疾病，由于铜代谢异常，铜在肝脏等组织沉积，损害肝细胞，引起肝功能异常，同时还会出现神经系统等方面的症状，如震颤、肌张力障碍等。