舌根溃疡的原因有多种。一般来说，创伤性因素是常见原因之一，比如牙齿咬伤舌根、进食了过烫过硬的食物擦伤舌根等；感染因素也可能导致，像病毒感染（如单纯疱疹病毒感染）、细菌感染等都有可能引发舌根溃疡；还有自身免疫性因素，当人体自身免疫系统出现问题时，也可能在舌根部位出现溃疡。
创伤性因素导致舌根溃疡
牙齿咬伤造成： 有些人在吃饭说话时不小心咬伤舌根，就容易形成溃疡，这种情况比较常见，尤其是在进食速度快或者牙齿排列不整齐的人群中更易发生。过烫过硬食物擦伤： 进食温度过高（比如刚出锅的热汤、热饭）或者食物过于坚硬（像脆硬的坚果等）时，很容易擦伤舌根黏膜，进而引发溃疡，一般这种情况有明确的饮食相关经历可寻。
感染因素引发舌根溃疡
病毒感染： 单纯疱疹病毒感染是常见的引发舌根溃疡的病毒因素，当人体抵抗力下降时，潜伏在体内的单纯疱疹病毒会活跃起来，导致舌根出现成簇的小水疱，随后破溃形成溃疡，这种情况可能会伴有疼痛、发热等症状，病程一般在1 - 2周左右。细菌感染： 一些细菌感染也可能导致舌根溃疡，比如金黄色葡萄球菌感染等，细菌感染引起的溃疡局部可能会有红肿、疼痛较为明显等表现。
自身免疫性因素导致舌根溃疡
自身免疫性疾病相关： 像白塞病等自身免疫性疾病，就可能累及舌根部位出现溃疡，这类疾病除了舌根溃疡外，还可能伴有口腔其他部位溃疡、眼部病变、生殖器溃疡等表现，需要进行相关自身抗体等检查来明确诊断。