腋窝里有肉疙瘩且伴有疼痛，可能是由以下原因引起的：
1.腋窝淋巴结炎：腋窝淋巴结炎通常由感染引起，如病毒、细菌或真菌感染。其他症状可能包括发热、寒战和乏力。
2.皮脂腺囊肿：皮脂腺囊肿是由皮脂腺分泌过多的皮脂堵塞而形成的囊肿。感染时，可能会出现疼痛和红肿。
3.副乳：副乳是除正常乳房外多余的乳房组织，也可能出现腋窝肿物和疼痛。
4.乳腺疾病：某些乳腺疾病，如乳腺炎、乳腺增生或乳腺癌，可能导致腋窝淋巴结肿大和疼痛。
5.其他原因：如外伤、脂肪瘤、纤维瘤等也可能引起腋窝肿物和疼痛。
如果腋窝里的肉疙瘩伴有疼痛，建议采取以下措施：
1.保持腋窝清洁：每天用温水清洗腋窝，避免感染。
2.避免刺激：避免摩擦、搔抓腋窝，穿着宽松的衣物。
3.就医诊断：及时就医，医生会进行详细的身体检查和相关检查，如超声、血常规等，以确定疼痛的原因。
4.治疗：根据病因进行治疗。如果是感染，可能需要使用抗生素；如果是囊肿或肿瘤，可能需要手术治疗。
需要注意的是，每个人的情况可能不同，因此最好在医生的指导下进行诊断和治疗。此外，如果疼痛持续加重或出现其他异常症状，应及时复诊。