细菌性阴炎主要是由阴道内正常菌群失调引起的混合感染，其中乳杆菌减少，加德纳菌及其他厌氧菌增加是常见原因。据统计，约10% - 40%的细菌性阴炎与阴道毛滴虫感染有关。
阴道生态环境改变
阴道pH值变化：正常阴道内pH值维持在3.8 - 4.4，这种酸性环境有利于乳杆菌生长，抑制其他病菌繁殖。当阴道pH值升高，比如达到6.0 - 6.5时，就容易引发细菌性阴炎。例如频繁性交、阴道灌洗等都可能改变阴道pH值。乳杆菌数量减少：乳杆菌是阴道内的有益菌，能产生过氧化氢等物质抑制病原体生长。长期使用抗生素会大量杀灭乳杆菌，使阴道内菌群平衡被打破，增加细菌性阴炎的发病风险。像长时间使用广谱抗生素的女性，患细菌性阴炎的几率就会明显高于常人。
菌群失调相关因素
性生活因素：多个性伴侣或者新性伴侣的更换，都可能导致阴道内菌群失衡。研究发现，有多个性伴侣的女性患细菌性阴炎的可能性比单一性伴侣者高约3倍。另外，性交后阴道pH值会暂时升高，也为病菌滋生创造了条件。卫生习惯问题：不恰当的卫生习惯也会引发细菌性阴炎。比如过度清洁阴道，频繁使用阴道洗液冲洗，会破坏阴道正常的酸性环境和菌群平衡。还有不注意经期卫生，使用不洁的卫生用品等，都容易让有害菌滋生，增加患病几率。
其他潜在因素
免疫力下降：当人体免疫力低下时，比如患有糖尿病等慢性疾病，或者长期服用免疫抑制剂，阴道局部的抵抗力会减弱，容易受到病菌侵袭，从而引发细菌性阴炎。糖尿病患者由于血糖高，阴道内糖原含量增加，pH值改变，更利于病菌生长繁殖。年龄因素：育龄期女性相对更容易患细菌性阴炎，这与她们的生理特点有关。青春期前和绝经后的女性，由于体内雌激素水平较低，阴道内环境与育龄期不同，患病几率相对较低，但也不是完全没有可能发病。