处在哺乳期的扁平疣患者，没有绝对最佳的治疗方式，通常建议在医生指导下选择外用药物治疗或物理治疗，同时要注意暂停哺乳。
一、外用药物治疗：
1.维A酸乳膏：对扁平疣有一定治疗效果，但使用需严格遵医嘱，不可随意乱用。
2.氟尿嘧啶软膏：是常用的治疗药物之一，同样要按照医生的指导来应用。
3.咪喹莫特乳膏：可用于扁平疣的医治，用药时要谨慎把握剂量和方法。
4.酞丁安乳膏：对于扁平疣的治疗有一定帮助，必须遵医嘱使用。
5.鬼臼毒素软膏：能发挥一定疗效，要注意正确使用。
6.苯扎溴铵溶液：也是治疗的选择之一，需遵循医嘱进行。
二、物理治疗：
1.冷冻：是有效的治疗手段，皮损数目多的话可以分批次进行。
2.电灼：可有效治疗扁平疣，治疗深度要达到真皮浅层，避免留疤。
3.刮除：属于治疗方法之一，操作时要注意恰当处理。
4.激光：对治疗扁平疣有效果，同样要注意治疗的细节。
此外，扁平疣主要通过直接或间接接触传播，人乳头瘤病毒会经皮肤黏膜微小破损进入上皮细胞内进行复制、增殖，而孩子的免疫功能相对较弱，所以在进行治疗时建议暂停哺乳，以免给孩子的健康带来不利影响。
总结概况提示：哺乳期扁平疣患者治疗方法主要有外用药物和物理治疗，治疗时应暂停哺乳，要注意根据具体情况在医生指导下选择合适的治疗方式和药物，同时要了解扁平疣的传播特点及对孩子的潜在影响。