肩胛骨疼的治疗方法需根据具体病因来定。一般来说，可通过物理治疗、药物治疗等方式缓解，部分情况可能需要手术干预。
物理治疗缓解
热敷： 可以用热水袋或热毛巾敷在肩胛骨疼痛部位，每次热敷15~20分钟，每天可进行3~4次。热敷能促进局部血液循环，缓解肌肉紧张，减轻疼痛。按摩： 找专业的按摩师进行肩胛骨周围的轻柔按摩，每次按摩时间约15~20分钟。按摩可以放松紧张的肌肉，改善局部的气血流通。不过，如果肩胛骨疼痛是由于骨折等较严重情况引起，就不能随意按摩，需先明确诊断。
药物辅助治疗
非甾体抗炎药： 像布洛芬等非甾体抗炎药有抗炎、止痛的作用。这类药物能减轻肩胛骨部位的炎症反应，从而缓解疼痛，但有胃溃疡等胃肠道疾病的患者要谨慎使用，需在医生指导下服用。肌肉松弛剂： 当肩胛骨疼是因为肌肉紧张痉挛导致时，可使用氯唑沙宗等肌肉松弛剂。它能放松过度紧张的肌肉，比如长时间保持不良姿势引起肩胛骨周围肌肉紧张，服用肌肉松弛剂可能有一定帮助。不过，孕妇等特殊人群使用需咨询医生。
纠正不良姿势
坐姿调整： 长时间伏案工作的人，要保持正确的坐姿，座椅高度要合适，使电脑屏幕处于眼睛水平位置，让背部挺直，双肩自然放松，避免含胸驼背，每工作1小时左右起身活动一下，伸展肩部和背部，每次活动5~10分钟。睡姿调整： 睡觉的时候选择合适的枕头，枕头高度一般以10厘米左右为宜，保持颈椎和胸椎的正常生理曲度，避免侧卧时肩部过度扭曲，影响肩胛骨周围的肌肉和关节。
针对病因的特殊处理
外伤导致： 如果肩胛骨是因为外伤引起疼痛，如骨折等情况，轻度的骨折可能需要用绷带固定，让受伤部位得到休息，一般需要固定3~6周左右；如果骨折较严重，可能需要进行手术治疗。在受伤后的24小时内可以先进行冷敷，减轻肿胀，之后再根据情况选择热敷等处理方式。疾病因素： 若是由于肩周炎等疾病引起肩胛骨疼，除了上述治疗方法外，还可以在病情允许的情况下进行适当的肩部功能锻炼，如爬墙运动等，但锻炼要循序渐进，避免过度加重疼痛。开始时每次爬墙运动坚持30秒左右，每天可进行3~4次，随着病情好转逐渐增加锻炼时间和幅度。