多囊卵巢综合征的发生与多种因素相关。目前认为，约50%的多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗，这会导致身体对胰岛素的敏感性降低，进而影响激素分泌等一系列生理过程。遗传因素也是重要原因之一，若家族中有亲属患有多囊卵巢综合征，那么女性患病风险会增加，有研究显示遗传因素占发病原因的40% - 70%。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 如果母亲或姐妹患有多囊卵巢综合征，那么自身患病几率比正常人群高很多。比如有家族史的女性，其基因中可能携带与多囊卵巢综合征相关的易感基因，这些基因会增加患病风险。基因层面影响： 目前已发现多个与多囊卵巢综合征相关的基因位点，这些基因会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，导致激素分泌失衡，从而引发多囊卵巢综合征。
内分泌失调方面
下丘脑 - 垂体功能异常： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）脉冲频率异常，会影响垂体分泌促卵泡生成素（FSH）和促黄体生成素（LH）。正常情况下，FSH和LH保持一定的比例，而多囊卵巢综合征患者往往出现LH水平升高，FSH水平相对偏低，LH/FSH比值大于2 - 3，这种失衡会影响卵巢的排卵功能。雄激素分泌过多： 卵巢和肾上腺都会分泌雄激素，多囊卵巢综合征患者体内雄激素水平升高，过多的雄激素会抑制卵泡发育，导致卵泡不能正常成熟和排卵，同时还会引起多毛、痤疮等临床表现。
生活方式方面
饮食不均衡： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食，会导致体重增加，而肥胖是多囊卵巢综合征的重要危险因素之一。例如，每天摄入过多油炸食品、甜品等，会使身体脂肪堆积，进而影响内分泌系统，增加患病几率。缺乏运动： 长期缺乏运动的人群，身体代谢率降低，容易出现胰岛素抵抗，也会增加多囊卵巢综合征的发病风险。一般建议每周至少进行150分钟的中等强度有氧运动，如快走、慢跑等，若长期不运动，患多囊卵巢综合征的可能性会明显上升。