多囊卵巢综合征的病因目前尚未完全明确，一般认为可能与遗传因素、内分泌失调以及生活方式等多方面有关。据研究，遗传因素在其中起到重要作用，如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合征，那么女性患病风险会增加。
遗传因素影响
家族遗传倾向： 多囊卵巢综合征具有一定的遗传易感性。如果母亲或姐妹患有多囊卵巢综合征，那么女性携带相关致病基因的概率会升高，有研究显示，约 20% - 60%的多囊卵巢综合征患者存在家族聚集现象。也就是说，如果家族中有女性患有该病，其他女性成员就要更加留意自身身体状况，定期进行相关检查。
内分泌失调缘由
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节紊乱： 正常情况下，下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴会保持相对平衡的调节状态。但在多囊卵巢综合征患者体内，这个轴的调节出现紊乱。垂体分泌的促黄体生成素（LH）水平升高，促卵泡生成素（FSH）水平相对较低，这种失衡会影响卵巢的正常排卵功能，导致卵巢持续不能正常排卵，进而引发一系列症状。例如，LH/FSH比值常常会大于 2 - 3。胰岛素抵抗因素： 很多多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗的情况。身体对胰岛素的敏感性降低，使得胰岛素不能正常发挥作用，从而导致血糖不能有效被调节。为了维持正常血糖水平，身体会代偿性地分泌更多胰岛素，形成高胰岛素血症。高胰岛素血症又会刺激卵巢分泌过多雄激素，进一步加重多囊卵巢综合征的症状，像多毛、痤疮等表现都可能与之相关。
生活方式关联
饮食不规律影响： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食习惯容易导致体重增加，而肥胖是多囊卵巢综合征的一个重要危险因素。当体重超标时，会影响身体的内分泌代谢功能，进而干扰下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的正常调节。比如，经常吃油炸食品、甜食，摄入过多高热量食物的人群，患多囊卵巢综合征的风险相对较高。缺乏运动作用： 缺乏体育锻炼也是一个不利因素。运动过少会使身体代谢减慢，脂肪容易堆积，同样可能引发胰岛素抵抗等问题，从而增加患上多囊卵巢综合征的可能性。建议每周至少进行 150 分钟的中等强度有氧运动，如快走、慢跑等，以维持身体良好的代谢状态。