二甲双胍是常用的降糖药物，但也可能带来一些副作用。一般来说，约有5%的患者在初始用药时可能出现胃肠道不适，比如约30%的人会有恶心、呕吐、腹泻等症状。
胃肠道方面的副作用
恶心呕吐： 部分人服用二甲双胍后会出现恶心的感觉，有的还会伴随呕吐，尤其是在刚开始用药的时候比较常见。比如一些患者在服药后的前几天，吃饭时就容易觉得恶心，不想吃东西。腹泻： 还有些人会出现腹泻症状，每天可能会有几次不成形的大便。不过一般随着用药时间的延长，部分人的腹泻症状会有所减轻，但也有一些人可能会一直存在轻微腹泻的情况。
对维生素吸收的影响
维生素B12缺乏： 长期服用二甲双胍可能会影响维生素B12的吸收。有研究发现，大约有7% - 30%长期服用二甲双胍的患者会出现维生素B12水平降低的情况。维生素B12缺乏可能会导致贫血、神经病变等问题，比如出现手脚麻木、感觉异常等表现。叶酸代谢变化： 二甲双胍还可能对叶酸的代谢产生一定影响，不过相对维生素B12缺乏来说，这方面的影响程度相对没那么突出，但也需要关注。
其他可能的副作用
乳酸酸中毒： 虽然比较罕见，但二甲双胍可能会引发乳酸酸中毒。不过这种情况通常发生在有严重肝肾功能不全、心肺功能不全等基础疾病的患者身上，一般人群发生的风险非常低，大约每10万人中可能有几例发生。体重变化： 部分患者服用二甲双胍后体重可能会有所下降，这是因为二甲双胍可以减少肝糖原输出，增加外周组织对葡萄糖的摄取和利用，从而起到一定的控制体重的作用，但也有少数人可能体重变化不明显。