肾结石的形成与多种因素相关，其中尿液中某些物质浓度过高是关键。一般来说，尿液中钙、草酸、尿酸等成分浓度异常升高，就容易形成肾结石。
代谢异常导致
尿液中钙含量过高： 当身体钙代谢出现问题时，尿液中的钙含量可能会升高。比如原发性甲状旁腺功能亢进患者，甲状旁腺激素分泌过多，会使骨钙大量释放，进而导致血钙和尿钙升高，增加肾结石形成风险。草酸排泄增多： 日常饮食中摄入过多富含草酸的食物，像菠菜、巧克力等，会使体内草酸含量增加。当草酸从尿液排出时，若尿液中草酸浓度过高，就容易与钙结合形成草酸钙结石。
尿路梗阻因素
尿道狭窄： 尿道因先天发育异常或者外伤等原因发生狭窄，会阻碍尿液正常排出。尿液在尿路中停留时间过长，其中的晶体物质就容易沉积，逐渐形成结石。比如一些男性因前列腺增生导致尿道狭窄，就可能引发肾结石相关问题。肾盂输尿管连接部狭窄： 这是一种先天性的尿路结构异常，会使尿液从肾盂流向输尿管的过程不顺畅，尿液淤积，为结石形成创造条件。
感染相关因素
细菌感染影响： 泌尿系统受到细菌感染时，细菌、脓块等会作为核心，促使尿液中的晶体物质围绕其沉积形成结石。例如大肠杆菌感染，会改变尿液的酸碱度等环境，有利于结石形成。感染引发尿液变化： 感染会使尿液的成分发生改变，比如产生尿素酶的细菌可分解尿液中的尿素，使尿液碱化，导致磷酸镁铵及磷酸钙沉积，形成感染性结石。
其他因素影响
水分摄入不足： 每天饮水量过少会使尿液浓缩，尿液中各种晶体物质的浓度相对升高，更容易析出形成结石。建议每天饮水量保持在2000 - 3000毫升以上，以稀释尿液，降低结石形成几率。某些疾病影响： 一些代谢性疾病，如痛风患者，血尿酸水平升高，尿酸经尿液排出增多，容易形成尿酸结石；还有肾小管酸中毒患者，尿液的酸碱平衡失调，也可能增加肾结石的发生风险。