肾结石微创手术费用在20000元至50000元不等。主要有两种微创手术方式，即输尿管软镜碎石取石术和经皮肾镜碎石取石术。
一、输尿管软镜碎石取石术：
1.适合处理2cm以下较小的肾结石，因其软镜较细小，碎石和清石速度较慢，较大结石往往一次难以清理干净。
2.手术是经尿道、膀胱、输尿管进入肾脏，属于自然腔道，无需打孔，具有出血少、创伤小、恢复快、痛苦小的特点。
3.但软镜属于一次性耗材，仅软镜费用通常就达30000多元，加上麻醉、手术费及药物等，总体通常需要50000元以上。
二、经皮肾镜碎石取石术：
1.适合处理大结石，如鹿角样结石或多发结石。
2.是通过在皮肤及肾脏打孔后直接处理结石，然后吸出结石，碎石和清石效率较高。
3.经皮肾镜往往可重复使用，所以费用比软镜低，加上全麻手术和其他药物治疗等一般需要20000元至30000元左右。
总之，肾结石微创手术有输尿管软镜碎石取石术和经皮肾镜碎石取石术两种，其适用情况和费用有所不同，可根据患者具体病情和经济状况等选择合适的手术方式。