肾结石微创手术费用在20000元至50000元不等。主要有两种微创手术方式，分别是输尿管软镜碎石取石术和经皮肾镜碎石取石术。
一、输尿管软镜碎石取石术：
1.适用情况：适合处理2cm以下的较小肾结石，因软镜较细小，对于较大结石往往一次难以清理干净。
2.手术途径：经尿道、膀胱、输尿管进入肾脏，属于自然腔道，无需打孔，具有出血和创伤较小、恢复较快、痛苦较小等特点。
3.费用构成：软镜属于一次性耗材，其费用通常就达30000多元，再加上麻醉、手术费以及药物等，通常需50000元以上。
二、经皮肾镜碎石取石术：
1.适用情况：适合处理大结石，如鹿角样结石或多发结石。
2.手术方式：通过经皮肤及肾脏打孔进入直接处理结石，然后吸出结石，碎石和清石效率较高。
3.费用情况：经皮肾镜往往可重复使用，所以费用比软镜低，加上全麻手术和其他药物治疗等一般需要20000元至30000元左右。
总之，肾结石微创手术有不同方式，其适用情况和费用各有差异，需根据患者具体病情来选择合适的手术方式。