胃食管反流常用的药物主要有抑酸药等。一般来说，质子泵抑制剂是治疗胃食管反流比较常用的药物，比如埃索美拉唑等，能有效抑制胃酸分泌。
抑酸类药物
质子泵抑制剂：这类药物能强效抑制胃酸分泌，像埃索美拉唑，可有效减少胃酸对食管黏膜的刺激，缓解胃食管反流引起的烧心、反酸等症状。不过，长期使用可能会有一些潜在影响，比如可能影响维生素B12的吸收等情况。H₂受体拮抗剂：例如雷尼替丁，它通过阻断组胺H₂受体来减少胃酸分泌，对轻至中度胃食管反流有一定的缓解作用，但抑制胃酸的强度相对质子泵抑制剂要弱一些。
促胃肠动力药物
多潘立酮：可以促进胃肠道蠕动，加快胃的排空，从而减少胃内容物反流到食管的机会。不过，服用多潘立酮可能会有一些不良反应，比如可能会出现头痛、头晕等情况，而且对于一些心脏有基础疾病的患者要谨慎使用，因为它可能会影响心脏电生理。莫沙必利：也是促进胃肠动力的药物，能增强胃肠道的蠕动，帮助胃内容物向下运行，缓解胃食管反流症状。它的不良反应相对较少，但也可能会有腹泻等不适表现。
黏膜保护剂
铝碳酸镁：能中和胃酸，还可以在食管黏膜表面形成保护屏障，减轻胃酸、胆汁等对食管黏膜的损伤。一般服用后能较快地缓解烧心、胃痛等症状，而且相对比较安全，不良反应较少见，但如果大量服用可能会引起便秘等情况。硫糖铝：同样可以在食管黏膜表面形成保护膜，保护食管黏膜免受胃酸等的侵蚀，对胃食管反流引起的不适有一定的缓解作用，但可能会导致便秘等问题，而且肾功能不全的患者要慎用。