尿分叉的治疗需先明确原因。若偶尔出现，多因生理原因，如久坐不运动、饮水过少及尿道口有粘连等，通常不会伴有其他症状，可通过适当运动、多饮水及多排尿来改善。若经常出现，则主要考虑与前列腺疾病、泌尿系统疾病相关，应前往医院检查并在医生指导下治疗。
一、前列腺疾病：
1.前列腺炎：好发于青年男性。除尿分叉外，还常有尿频、尿急、尿痛、寒战、发热等表现。临床治疗常以喹诺酮类抗生素（如左氧氟沙星）、呋喃类抗生素、氨苄西林等广谱抗生素类药物为主，比如阿奇霉素等。
2.前列腺增生：多见于老年男性。除尿分叉外，典型症状还有夜尿增多、排尿困难、排尿无力等。治疗以改善前列腺增生动态梗阻和静态梗阻的药物为主，如α受体阻滞剂和5α-还原酶抑制剂等。若前列腺增生严重，还可能出现尿潴留，此时可进行经尿道前列腺电切术治疗。
3.前列腺癌：症状类似前列腺增生，需通过直肠指诊、前列腺特异性抗原、前列腺活检等进行鉴别诊断，一般需手术切除治疗。
二、泌尿系统疾病：
1.尿道结石：临床主要表现为尿潴留、尿分叉、点滴状排尿、尿痛等。结石取出后，尿分叉症状通常会消失。
2.龟头炎：龟头部分有红斑、糜烂等特征表现。若治疗不当，可能导致瘢痕组织形成，从而引发尿分叉。治疗时可根据不同感染因素选择不同抗菌药物，如因白色念珠菌引起可使用伊曲康唑，因厌氧菌感染引起可使用甲硝唑，若因过敏引起的尿分叉可使用倍他米松等药物。
3.尿道炎：是较常见的泌尿生殖道感染疾病。除尿分叉外，还会有尿频、尿痛、尿道白色脓性分泌物等。治疗药物可选用头孢类抗生素，如头孢曲松等。
此外，尿道外伤或慢性炎症形成的瘢痕也会导致尿分叉，可定期进行尿道扩张治疗，一般可缓解尿分叉，但因瘢痕不易去除，所以不易完全治愈。
总之，尿分叉的原因多样，治疗方法也各不相同，需根据具体情况进行针对性治疗。