睡觉醒来出现心悸心慌可能由多种原因引起。比如，健康人在精神紧张、大量吸烟、饮酒、喝浓茶或咖啡后，或在剧烈运动、过度疲劳时都可能出现这种情况，一般通过休息可缓解。
生理性因素导致
睡眠质量不佳： 如果夜间睡眠过程中多梦、易醒，睡眠深度不够，大脑没有得到充分休息，醒来后就可能出现心悸心慌。比如有些人夜间睡眠中频繁觉醒，觉醒次数超过2次/小时，就可能影响心脏的正常节律感受。体位变化： 睡眠中突然改变体位，可能会刺激心血管系统，导致短暂的心悸心慌。比如从平卧位突然变为侧卧位，身体姿势的改变可能影响血液循环，引发心脏的短暂不适反应。
病理性因素导致
心脏疾病： 像心律失常，如早搏，包括房性早搏、室性早搏等，在睡眠中可能因为迷走神经和交感神经平衡失调等原因诱发，醒来后能感觉到心悸心慌。还有冠心病患者，冠状动脉供血不足，在睡眠时心肌供血相对减少，醒来后可能出现心悸心慌症状。一般冠心病患者冠状动脉狭窄程度如果超过50%就可能影响心肌供血。内分泌疾病： 甲状腺功能亢进患者，由于甲状腺激素分泌过多，机体代谢加快，交感神经兴奋，即使在睡眠中也可能出现心跳加快的情况，醒来后就会有心悸心慌表现。通常甲状腺功能检查中甲状腺素（T4）、三碘甲状腺原氨酸（T3）等指标会明显高于正常范围。
其他因素导致
药物影响： 某些药物在服用后可能有心悸心慌的不良反应。比如一些抗抑郁药、支气管扩张剂等，服用后可能影响心脏的电生理活动或交感神经功能，导致醒来后心悸心慌。例如服用沙丁胺醇这类支气管扩张剂，部分人可能出现心跳加快的副作用。贫血： 重度贫血患者，血液携氧能力下降，身体各器官包括心脏都处于相对缺氧状态，睡眠中身体代谢减慢但心脏仍需努力工作来维持供氧，醒来后就容易出现心悸心慌。一般血常规检查中血红蛋白浓度低于正常范围，如成年男性血红蛋白＜120g/L，成年女性＜110g/L（孕妇＜100g/L）可诊断为贫血。