变异性哮喘的发病原因目前尚未完全明确，但一般认为与遗传因素和环境因素密切相关。遗传因素方面，研究发现如果家族中有哮喘等过敏性疾病的患者，个体患变异性哮喘的风险会增加，有数据显示约30% - 50%的变异性哮喘患者有家族过敏史。
遗传因素相关情况
家族遗传倾向： 变异性哮喘具有一定的遗传易感性。如果父母一方患有变异性哮喘，子女患该病的概率比正常人群高；若父母双方都患病，子女患病概率会进一步升高。这种遗传倾向是由基因决定的，某些特定的基因位点与变异性哮喘的发病相关，使得个体的免疫系统更容易对环境中的过敏原产生过度反应。
环境因素相关情况
过敏原接触： 是重要的环境诱因。常见的过敏原包括室内的尘螨，尘螨微小，主要生活在床垫、枕头、沙发等处，室内湿度适宜时容易滋生，据统计，约80%的变异性哮喘患者对尘螨过敏；还有花粉，不同季节有不同的花粉过敏原，春季的杨树、柳树花粉，秋季的蒿草花粉等，接触后可引发呼吸道过敏反应，导致变异性哮喘发作；宠物的毛发、皮屑也是常见过敏原，猫、狗等宠物的皮屑中含有的蛋白质容易引起人体免疫反应，诱发疾病。空气污染： 室外的空气污染如工业废气、汽车尾气中的有害颗粒和化学物质，以及室内的空气污染，像装修材料释放的甲醛、苯等挥发性有机物，长期接触这些污染物质会刺激呼吸道，损伤气道黏膜，使气道敏感性增高，从而增加变异性哮喘的发病风险。例如在空气污染严重的城市，变异性哮喘的发病率相对较高。呼吸道感染： 病毒、细菌等感染也是诱因之一。儿童时期反复的呼吸道病毒感染，如鼻病毒、流感病毒等感染，可能会损伤呼吸道上皮细胞，破坏气道的防御功能，导致气道高反应性，进而引发变异性哮喘。有研究表明，5岁以下儿童因呼吸道感染诱发变异性哮喘的比例可达20%左右。