早上起来眼睛浮肿的原因包括正常现象和病理性原因。正常现象如熬夜会影响血液循环，使废水不能排出而导致眼睛浮肿。病理性原因有：一、过敏性结膜炎，由接触过敏原刺激引起，会有眼睛红肿、疼痛、瘙痒等症状，可遵医嘱口服盐酸西替利嗪片、氯雷他定片等；二、角膜炎，多由外部微生物侵入感染，如细菌或病毒感染，表现为眼睛疼痛、流眼泪、畏光、视力减退等，可根据医生指导使用咪康唑眼药水、妥布霉素滴眼液等药物治疗。此外，也可能是肾病所致，通常需要进一步检查诊断以明确具体原因。
总结概况提示：早上眼睛浮肿可能是正常熬夜导致，也可能是过敏性结膜炎、角膜炎或肾病等病理性因素引起，应根据具体情况进行判断和处理。