直肠脱垂的治疗方法需根据病情严重程度等因素决定。一般来说，轻度直肠脱垂可通过非手术治疗改善，重度可能需要手术。
非手术治疗为主的情况
一般治疗：
儿童直肠脱垂： 儿童直肠脱垂多可自愈，一般通过改善排便习惯等方法。比如让孩子养成每天定时排便的好习惯，排便时间控制在5分钟以内。同时，孩子应增加膳食纤维的摄入，像多吃蔬菜（如菠菜、西兰花等）、水果（如香蕉、苹果等），保证每天摄入足够的膳食纤维，一般建议儿童每天膳食纤维摄入量在15~25克左右。成人轻度直肠脱垂： 成人轻度直肠脱垂也可先尝试一般治疗。要避免长时间蹲厕，每次排便时间最好不超过10分钟。同时，可进行提肛运动，每天进行3~4次提肛运动，每次持续5~10秒，长期坚持有助于改善症状。
注射治疗
硬化剂注射：
通过将硬化剂注射到直肠周围，使直肠与周围组织粘连固定。常用的硬化剂有5%石炭酸植物油等。该方法适用于儿童和轻度成人直肠脱垂，但可能存在复发的情况，一般复发率在10%~20%左右。注射时要注意严格掌握剂量和部位，避免并发症的发生。
手术治疗情况
直肠悬吊固定术：
这是一种较为常用的手术方式。适用于重度直肠脱垂患者。手术是将直肠向上悬吊并固定在骶骨前筋膜等部位，以恢复直肠的正常位置。该手术的复发率相对较低，约在5%左右，但手术有一定的创伤，术后需要一段时间恢复，一般术后住院时间在7~10天左右。
肛门环缩术：
适用于年老体弱或不能耐受较大手术的直肠脱垂患者。手术是通过放置硅胶环或尼龙带等，缩小肛门，防止直肠脱垂。但该方法复发率相对较高，约在30%左右，且可能会引起肛门不适等并发症。