小便时龟头会感到刺痛，可能由龟头炎、尿道炎、尿道结石等因素引起，需就医检查与治疗，以防出现严重并发症。
一、龟头炎：若男性存在包皮过长或包茎情况，易藏污纳垢，可能诱发包皮龟头炎。因炎症刺激，会使龟头及尿道口部位黏膜或皮肤受损，排尿时尿液刺激损伤处，导致龟头刺痛，龟头局部还常有瘙痒等表现。治疗可使用红霉素软膏等药物。
1.病因：包皮过长或包茎导致污垢积聚。
2.症状表现：龟头刺痛、局部瘙痒。
3.治疗药物：红霉素软膏。
二、尿道炎：男性日常不注意下体卫生或有不洁性生活，可使尿道黏膜发生炎症感染，造成尿道局部刺激损伤，排尿时龟头疼痛，通常伴有尿频、尿急、尿道烧灼感等症状。应在医生指导下选用敏感抗生素治疗，如阿莫西林、阿奇霉素等。
1.原因：不注意卫生或不洁性生活。
2.症状：龟头疼痛、尿频、尿急、尿道烧灼感。
3.治疗用药：阿莫西林、阿奇霉素等敏感抗生素。
三、尿道结石：排尿时结石活动刺激导致黏膜损伤，引起小便时龟头刺痛，可能还伴有排尿困难、血尿等症状。当结石无法自行排出时，应考虑进行激光碎石术。
1.原因：结石活动刺激黏膜。
2.症状：龟头刺痛、排尿困难、血尿。
3.治疗方法：激光碎石术。
总之，当出现小便时龟头刺痛的情况，应尽快明确原因，并采取针对性的治疗措施，避免病情进一步发展。