慢性咽炎的药物治疗需根据病情选择，常用的有含漱液、含片等。一般来说，常用的含漱液如复方硼砂含漱液，可清洁口腔、杀菌消炎，能在一定程度上缓解慢性咽炎症状；含片类如碘喉片，能缓慢释放出碘，有杀菌、收敛作用，可减轻咽部炎症。
局部治疗药物
含漱液类： 复方硼砂含漱液是比较常用的，它能通过含漱，对咽部的细菌等起到一定的抑制作用，帮助清洁咽部环境，一般每天可含漱数次。含片类： 西地碘含片也是常见的，其主要成分西地碘在唾液作用下逐渐释放出碘，可杀菌、抗感染，缓解咽部不适，但对碘过敏者禁用。
中成药类
清热解毒类： 咽炎片就属于这类，它含有玄参、天冬、牡丹皮等多种中药成分，具有养阴润肺、清热解毒、清利咽喉、镇咳止痒的功效，可用于慢性咽炎引起的咽干、咽痒、刺激性咳嗽等症状。利咽消肿类： 清喉利咽颗粒也是常用的，它能清热利咽、宽胸润喉，对于慢性咽炎导致的咽部异物感等有一定的缓解作用，但糖尿病患者需要慎用。
西药中的辅助类药物
维生素类： 补充维生素B₂等，可促进黏膜上皮生长，有助于咽部黏膜的修复。因为维生素B₂参与体内很多代谢过程，对维持黏膜的正常功能有一定帮助。黏液溶解促排剂： 如桉柠蒎肠溶软胶囊，它可以稀化黏液并促进纤毛活动，使黏液易于排出，从而减轻咽部因黏液刺激引起的不适，但在服用时需注意用温水送服，避免打开胶囊服用。不过，药物治疗只是一方面，患者还需注意改善生活习惯，比如要避免过度用嗓，尽量少说话；要保持室内空气湿润，空气干燥也容易刺激咽部；还要注意清淡饮食，避免吃辛辣、油腻、刺激性食物等，这样综合起来才能更好地控制慢性咽炎的症状。