喝黑咖啡减肥可能存在一些坏处。首先，过量饮用黑咖啡可能会对胃肠道产生刺激。有研究表明，长期大量喝黑咖啡的人，约有10% - 15%会出现不同程度的胃部不适，比如胃痛、胃酸过多等情况。
对心血管系统的影响
心率方面： 黑咖啡中含有咖啡因，它能刺激中枢神经系统，使心率加快。一般来说，健康人一次性摄入超过200毫克咖啡因（约2 - 3杯较浓的黑咖啡），可能会让心率在短时间内提高10 - 20次/分钟。长期大量饮用黑咖啡，还可能影响心血管的正常调节功能，增加心血管疾病的潜在风险。血压影响： 对于部分人群，尤其是本身有血压问题或者对咖啡因比较敏感的人，喝黑咖啡可能会导致血压短时间升高。有研究发现，正常人群在饮用黑咖啡后，收缩压可能会上升5 - 10毫米汞柱，舒张压也可能有一定程度的升高。
对睡眠的干扰
入睡困难： 咖啡因具有兴奋神经的作用，会抑制褪黑素的分泌，而褪黑素是帮助人体入睡的重要激素。如果在晚上6点以后喝黑咖啡，大约有30% - 40%的人会出现入睡困难的情况，原本需要30分钟左右入睡的人，可能需要延长1 - 2小时才能入睡。睡眠质量下降： 即使入睡了，由于咖啡因的影响，睡眠质量也会受到影响。喝黑咖啡后睡眠过程中会更容易醒来，深度睡眠时间减少，导致第二天感觉疲惫、精神不佳。
对钙吸收的影响
阻碍钙吸收： 咖啡因会增加尿液中钙的排出量。长期大量喝黑咖啡，比如每天饮用5杯以上，会使人体对钙的吸收效率降低。有数据显示，长期大量喝黑咖啡的人群，相比不喝黑咖啡的人群，每年骨钙流失量会增加约1% - 2%，这对于骨骼健康不利，尤其是对于骨质疏松的高危人群，如老年人、绝经后的女性等，危害更大。