三个月没来月经可能存在诸多危害，比如：导致子宫内膜增生、影响备孕、引起内分泌失调等。具体如下：
一、导致子宫内膜增生：子宫内膜通常会在月经来临前脱落，若是长时间不来月经，就可能致使子宫内膜过度生长，进而引发子宫内膜增生。对此种情况，患者可遵医嘱使用如醋酸甲羟孕酮片、炔诺酮片、复方醋酸甲地孕酮片等药物进行治疗。
1.醋酸甲羟孕酮片：是一种孕激素类药物，可用于治疗由内分泌失调引起的子宫内膜增生等疾病。
2.炔诺酮片：能调节女性体内孕激素水平，对子宫内膜增生有一定的改善作用。
3.复方醋酸甲地孕酮片：可抑制子宫内膜过度增生。
二、影响备孕：正常女性一般在月经前排卵，而月经周期过长可能会导致排卵减少，排卵减少自然会影响到备孕。所以这种情况下，三个月没来月经可能会对备孕产生不利影响。一般建议女性前往医院检查，根据排卵情况合理安排同房时间，以提高怀孕的几率。
三、引起内分泌失调：若只是偶尔出现三个月没来月经的情况，通常表明月经周期不规律，而这可能会对雌激素、孕激素的正常分泌造成影响，引发内分泌失调，使患者出现面色晦暗、脾气暴躁、月经量异常等表现。针对这种情况，患者可遵医嘱使用药物进行治疗，如乌鸡白凤丸、益母草颗粒、当归丸等。
1.乌鸡白凤丸：有补气养血、调经止带的功效，可用于改善内分泌失调引起的月经不调等症状。
2.益母草颗粒：可活血调经，对内分泌失调引发的月经异常有一定疗效。
3.当归丸：能养血活血、调经止痛，有助于缓解内分泌失调相关症状。
总之，三个月没来月经需要引起重视，应及时就医，明确原因，并根据具体情况采取相应的治疗措施。