心脏神经官能症的病因目前尚未完全明确，一般认为可能与多种因素有关。据研究，大约有10% - 20%的心血管门诊患者可能患有心脏神经官能症。
心理社会因素方面
精神压力过大：长期处于高强度的工作压力、生活压力下，比如工作中面临频繁的业绩考核、家庭中遭遇重大变故等情况，会使人体神经内分泌系统失调，进而影响心脏的正常功能调节，增加患心脏神经官能症的风险。据统计，长期精神高度紧张的人群患病几率比普通人高约3 - 5倍。性格特点影响：一些性格较为内向、敏感、焦虑、抑郁的人更容易患上心脏神经官能症。这类人群往往对身体的细微变化过度关注，心理承受能力相对较弱，当遇到生活中的应激事件时，更易出现神经功能紊乱，从而引发心脏相关的不适症状。
神经生物学因素方面
神经递质失衡：体内的神经递质如5 - 羟色胺、去甲肾上腺素等在情绪调节和心血管功能调控中起着重要作用。当这些神经递质出现失衡时，就可能干扰心脏的正常神经调节，导致心脏神经官能症的发生。例如，5 - 羟色胺水平降低可能与焦虑、抑郁等情绪问题相关，进而影响心脏的神经功能。自主神经功能紊乱：自主神经系统分为交感神经和副交感神经，它们相互平衡协调地调节心脏等器官的功能。如果自主神经功能发生紊乱，交感神经兴奋占优势或者副交感神经相对不足时，就会出现心悸、胸闷、气短等类似心脏病的症状，但实际上心脏本身并没有器质性病变，这就是心脏神经官能症的一种表现。
其他可能因素方面
遗传易感性：有研究发现，心脏神经官能症可能存在一定的遗传倾向。如果家族中有亲属患有类似的神经官能症，那么个体患病的几率可能会相对增加。虽然具体的遗传机制还不十分清楚，但遗传因素在发病中起到了一定的作用。环境因素刺激：长期处于不良的生活环境中，比如噪音过大、空气污染严重等，也可能对神经系统产生刺激，影响心血管的神经调节，从而诱发心脏神经官能症。例如，长期生活在噪音超过70分贝的环境中，连续3个月以上，患心脏神经官能症的可能性会明显提高。