口腔溃疡的用药需根据具体情况选择，一般来说局部用药较为常用。比如西瓜霜喷剂，能起到一定的清热、消肿、止痛作用，可缓解口腔溃疡带来的不适，通常喷后能在一定程度上减轻疼痛、促进创面愈合。
局部外用药物
含漱剂： 氯己定含漱液是比较常用的，它可以杀灭口腔内的细菌，抑制细菌繁殖，有助于减轻口腔溃疡部位的炎症。使用时按照说明书要求，每天含漱一定次数。散剂： 冰硼散也是常见的治疗口腔溃疡的散剂，具有清热解毒、消肿止痛的功效，将其撒于溃疡表面，能缓解疼痛，促进溃疡愈合，但儿童使用时要注意避免误吞。
促进愈合的药物
重组人表皮生长因子凝胶： 它能促进口腔黏膜上皮细胞的增殖、迁移，加速溃疡创面的愈合。使用时清洁口腔后，取适量凝胶涂抹于溃疡处。维生素类药物： 口服维生素B₂、维生素C等，从一定程度上可以辅助口腔溃疡的愈合。维生素B₂参与体内生物氧化与能量代谢等过程，维生素C能促进胶原蛋白合成等，对维持黏膜的正常功能有帮助。
针对病因的药物
如果是缺乏微量元素引起的口腔溃疡： 可以适当补充锌制剂等。锌在人体的生长发育、免疫调节等方面都有重要作用，缺乏锌可能导致口腔溃疡反复发作，在医生指导下补充锌剂可能有助于改善情况。如果是因免疫力低下导致的口腔溃疡： 可以在医生评估后使用一些调节免疫力的药物，比如转移因子口服液等，但这类药物的使用需要严格遵循医嘱，因为不同人群的具体情况不同，用药需要谨慎。需要注意的是，对于口腔溃疡，首先要尽量明确病因，然后针对性用药。同时，在用药过程中要注意观察病情变化，如果口腔溃疡长时间不愈合或者反复发作，应及时就医，进一步检查和治疗，避免延误病情。而且在使用任何药物前，最好先咨询医生或药师，尤其是儿童、孕妇、哺乳期女性等特殊人群，用药更要谨慎。