扁平尤是由人类乳头瘤病毒（HPV）感染引起的良性赘生物，一般可以通过多种方法治疗，通常经过规范治疗，多数人可以治好。比如外用药物治疗中，常用的有维A酸类药物等，部分人使用后能见到效果。
外用药物治疗
维A酸类药物： 像维A酸乳膏就可以使用，它能调节表皮细胞的分化和增殖，对扁平尤有一定的治疗作用，但使用时要注意避免接触正常皮肤，而且可能会有局部刺激症状，如轻度的红斑、脱屑等。5%咪喹莫特乳膏： 属于免疫调节剂，通过刺激机体的免疫反应来清除病毒。不过使用时要遵医嘱，部分人使用后可能会出现局部皮肤的炎症反应，如红肿、瘙痒等。
物理治疗方法
冷冻治疗： 利用低温使扁平尤组织坏死脱落。一般需要多次治疗，每次冷冻后局部会出现水疱、结痂，然后脱落。治疗后要保持局部清洁干燥，避免感染，冷冻部位可能会留下暂时的色素沉着。激光治疗： 用激光的高能量烧灼扁平尤组织，使其碳化、脱落。治疗后创面要注意护理，防止感染，也可能会有一定的疤痕形成风险，尤其是疤痕体质的人要谨慎选择。
自体免疫疗法
注射卡介菌多糖核酸： 它可以调节机体的免疫功能，增强免疫力来对抗HPV感染。一般需要按疗程注射，每周注射2 - 3次，持续一段时间。在注射过程中要注意观察是否有过敏等不良反应，如出现皮疹、瘙痒等要及时告知医生。
日常注意事项
避免搔抓： 扁平尤患者要尽量避免搔抓患处，因为搔抓可能会导致病毒自身接种，使皮疹越来越多。注意个人卫生： 要保持皮肤清洁，勤换衣物，不和他人共用毛巾、脸盆等个人物品，防止交叉感染。同时，要注意增强自身免疫力，保持良好的生活习惯，如充足的睡眠、合理的饮食等，有助于疾病的恢复和预防复发。