扁平尤目前较难完全根治，但可通过多种方法控制和改善。一般来说，治疗方法包括药物治疗、物理治疗等，其中药物治疗常用的有维A酸类药物等，但具体效果因个体差异而异。
药物治疗方式
外用药物： 可以使用维A酸类药膏，如维A酸乳膏等，它能调节细胞分化，对扁平尤有一定的治疗作用，但起效相对较慢，可能需要连续使用数周甚至数月才能看到明显效果。内服药物： 对于病情较严重或外用药物效果不佳的患者，可能会使用免疫调节剂等内服药物，比如转移因子口服液等，它能调节机体免疫功能，帮助机体对抗病毒，但药物起效时间和效果因个体免疫状态不同而有差异。
物理治疗手段
冷冻治疗： 是利用低温使扁平尤组织坏死脱落。一般需要多次治疗，间隔时间通常为2 - 3周左右，每次冷冻后局部可能会出现水疱、结痂等反应，需要注意保持局部清洁，避免感染。激光治疗： 利用激光的能量烧灼扁平尤组织。治疗后局部会有创面，需要注意创面护理，防止感染，一般1 - 2周创面可愈合，但也存在复发的可能。
日常注意事项
避免搔抓： 扁平尤具有传染性，搔抓可能会导致自身接种，使皮疹增多。所以要尽量避免用手搔抓患处，防止病情扩散。增强免疫力： 日常生活中要注意保持良好的生活习惯，保证充足的睡眠，一般成年人每天建议7 - 8小时的睡眠时间，适当进行体育锻炼，如散步、慢跑等，每周至少进行3 - 5次，每次30分钟以上，以增强机体免疫力，有助于病情的控制和恢复。注意个人卫生： 要勤换衣物，保持皮肤清洁，不与他人共用毛巾、脸盆等个人物品，防止交叉感染。