发烧治愈后头疼可能与多种因素有关。一般来说，发烧时身体代谢加快，体内会产生一些炎性介质，即使烧退了，这些介质的影响可能还会持续一段时间，从而导致头疼，大约有30% - 50%的人在发烧后会出现头疼情况。
身体未完全恢复导致
炎症残留影响：发烧往往是身体对抗感染的过程，体内存在炎症反应，虽然体温恢复正常，但炎症相关的一些物质，像前列腺素等可能还没有完全清除干净，它们会刺激头部的神经，引发头疼。比如细菌感染引起的发烧，身体在清除细菌后，局部炎症部位的前列腺素等物质消退需要一定时间，这期间就可能导致头疼。能量消耗与身体虚弱：发烧时身体消耗大量能量，身体处于相对虚弱的状态。当发烧治愈后，身体需要时间来恢复能量储备和各项机能。这种身体的虚弱状态可能会影响头部的血液循环等，进而出现头疼。一般身体需要1 - 2天来逐步恢复，在恢复过程中可能头疼会持续存在。
水分电解质失衡因素
脱水情况：发烧的时候，人体会通过出汗等方式散热，容易导致水分丢失，如果没有及时补充水分，就会出现脱水现象。脱水会使血液浓缩，脑部的血液供应相对不足，从而引发头疼。一般发烧时每小时可能丢失200 - 500毫升水分，若未及时补充，就容易出现脱水相关头疼。电解质紊乱：发烧时，身体的电解质平衡也可能被打破，像钠、钾等电解质的失衡会影响神经肌肉的正常功能，也可能导致头疼。例如发烧导致大量出汗，汗液中不仅丢失水分，还会丢失一定量的钠等电解质，当体内钠含量过低时，就可能引起头疼、乏力等不适。
神经调节功能紊乱
体温波动后的影响：发烧过程中体温的波动会对神经系统产生一定刺激，即使体温恢复正常，神经系统的调节功能可能还没有完全恢复到正常状态。比如体温快速上升或下降时，会干扰脑部神经的正常传导，使得神经调节紊乱，进而出现头疼。这种神经调节功能的恢复可能需要3 - 5天的时间。个体差异导致：不同人对发烧的耐受程度和恢复能力不同，有些人发烧后头疼可能更明显。比如本身有偏头痛病史的人，发烧后更容易诱发头疼发作。这类人群在发烧治愈后，头疼的概率可能相对更高，而且头疼的持续时间和严重程度也可能有所不同。