小儿反复发烧的原因有多种，比如感染性因素较为常见，像病毒感染就可能导致小儿反复发烧，其中常见的如流感病毒等引起的感染，有数据显示儿童流感时反复发烧的情况较为多见。
感染性因素导致反复发烧
病毒感染： 多种病毒都能引发小儿反复发烧，像呼吸道合胞病毒感染，常导致小儿出现咳嗽、鼻塞、反复发烧等症状，病程可能持续3 - 5天甚至更久。细菌感染： 常见的有肺炎链球菌引起的肺炎，小儿会出现反复发热、咳嗽、咳痰等症状，血常规检查往往能发现白细胞升高等细菌感染迹象。
非感染性因素导致反复发烧
自身免疫性疾病： 比如幼年特发性关节炎，小儿会出现反复发烧的情况，同时还可能有关节肿胀、疼痛等表现，这类疾病需要通过一系列的实验室检查来明确诊断。中暑： 在炎热的环境下，小儿体温调节中枢功能不完善，容易出现中暑，表现为反复发烧，同时可能伴有皮肤潮红、口渴、乏力等症状。如果在高温环境中停留时间较长，就容易引发。肿瘤性疾病： 虽然相对少见，但一些肿瘤性疾病也会导致小儿反复发烧，例如白血病，除了反复发烧外，还可能有贫血、出血、肝脾淋巴结肿大等表现。
其他因素导致反复发烧
环境因素： 如果小儿穿着过多、室内温度过高，也可能引起体温短暂升高，但一般通过调整环境后体温能恢复正常。不过如果环境因素持续存在，也可能导致反复发烧的情况出现。疫苗接种反应： 小儿在接种某些疫苗后，可能会出现短暂的反复发烧，一般体温不会太高，多在38.5℃以下，持续1 - 2天左右会自行缓解。