小儿反复发烧的原因有多种，其中感染性因素较为常见。比如病毒感染，像流感病毒引起的流感，可能导致小儿反复发烧，病程通常可持续3 - 5天左右；细菌感染也是常见原因，例如肺炎链球菌引起的肺炎，小儿会出现反复发热的情况，还可能伴有咳嗽、咳痰等症状。
感染性因素
病毒感染： 多种病毒可引发小儿反复发烧，像呼吸道合胞病毒，它是引起婴幼儿下呼吸道感染的常见病原体之一，常导致小儿出现发热、咳嗽、喘息等症状，发热一般会持续2 - 7天不等。另外，EB病毒感染也会让小儿反复发烧，还可能伴有淋巴结肿大、肝脾肿大等表现。细菌感染： 常见的有链球菌感染，A组乙型溶血性链球菌感染可引起小儿猩红热，除了反复发烧外，还会出现草莓舌、全身弥漫性红色皮疹等症状。还有大肠杆菌感染，若小儿泌尿系统受到大肠杆菌侵袭引发尿路感染，也会出现反复发热，同时可能有尿频、尿急、尿痛等表现。
非感染性因素
自身免疫性疾病： 比如幼年特发性关节炎，这是儿童时期常见的风湿性疾病，主要表现为反复发热，还会有关节肿胀、疼痛、畸形等症状，发热可持续数周甚至数月。还有系统性红斑狼疮，虽然在小儿中相对少见，但也可能出现反复发烧，同时伴有面部红斑、口腔溃疡、脱发等症状。恶性肿瘤： 像白血病，小儿急性白血病时，会出现反复发热，还可能伴有贫血、出血、肝脾及淋巴结肿大等表现，发热一般为低热或中度发热，但也有部分患儿会出现高热。另外，恶性淋巴瘤也可能导致小儿反复发烧，同时可触及无痛性淋巴结肿大。环境因素： 如果小儿穿着过厚、室内温度过高，可能会引起散热不良，出现反复低热的情况。一般调整环境温度和衣物后，体温可逐渐恢复正常。还有下丘脑体温调节中枢异常，比如颅脑外伤、颅内肿瘤等情况影响到体温调节中枢，也可能导致小儿反复发烧。