遗尿症的原因较为复杂，一般来说，3 - 5岁儿童约15%有夜间遗尿，随着年龄增长，发生率会逐渐降低，但仍有少数人会持续到成年。
神经系统发育不完善
儿童时期常见：对于3 - 12岁的儿童，神经系统还在不断发育成熟过程中。例如，膀胱的排尿功能受大脑皮层和脊髓的神经调控，若儿童的神经系统发育迟缓，可能无法很好地控制膀胱的排尿反射，导致夜间遗尿。一般随着年龄增长，大部分儿童的神经系统发育完善后，遗尿情况会改善。特殊情况：某些儿童可能存在脊髓神经传导异常等问题，也会影响对排尿的控制，从而引发遗尿。
睡眠因素
深度睡眠影响：部分遗尿儿童存在睡眠过深的情况。人在睡眠时，大脑对膀胱的信号感知会减弱。比如，当膀胱有尿意时，深度睡眠的人可能很难被唤醒去排尿，就容易发生遗尿。一般深度睡眠的状态持续时间过长或者程度过深，就更易出现这种情况。睡眠周期紊乱：还有些孩子睡眠周期紊乱，导致不能及时在膀胱充盈时醒来。正常的睡眠周期包括浅睡眠和深睡眠，若睡眠周期异常，就可能错过膀胱排尿信号的接收时机，引发遗尿。
膀胱功能异常
膀胱容量小：有些儿童膀胱容量比正常儿童小，这就意味着膀胱储存尿液的能力较弱。例如，正常儿童膀胱能储存一定量尿液才会产生尿意，而膀胱容量小的孩子，尿液稍微充盈就会有尿意，且夜间难以耐受，容易遗尿。一般通过检测可以发现这类孩子的膀胱容量低于正常范围。膀胱不稳定收缩：部分孩子的膀胱会出现不稳定收缩的情况，即使膀胱内尿液量还未达到正常引发排尿的量，膀胱也会不自主收缩，导致尿液排出，从而引起遗尿。这种不稳定收缩可能与膀胱肌肉的神经调节异常有关。
心理因素
压力过大：如果孩子近期面临较大的心理压力，比如换了新环境、受到学业等方面的压力，就可能引发遗尿。例如，刚进入新学校的孩子，因为不适应新环境，心理紧张，可能会出现夜间遗尿的情况。一般这种心理因素导致的遗尿，在压力解除后，遗尿情况可能会有所改善。情绪紧张：长期处于紧张、焦虑情绪中的孩子也容易发生遗尿。比如家庭关系不和睦等情况，会让孩子情绪紧张，影响神经系统对膀胱的控制，进而引发遗尿。