一、遗传因素
部分甲状腺囊性结节的发生与遗传易感性相关，若家族中有甲状腺疾病患者，个体携带相关遗传突变的概率升高，从而增加患甲状腺囊性结节的风险。例如，某些特定基因的突变可能影响甲状腺细胞的正常生长、分化及代谢调控，使甲状腺更易出现囊性结构异常。
二、碘摄入异常
1.碘缺乏：当机体长期处于碘缺乏状态时，甲状腺为维持正常功能会发生代偿性增生，在此过程中可能出现滤泡结构异常，进而形成囊性结节。例如，碘缺乏地区人群甲状腺囊性结节的发生率相对较高。
2.碘过量：碘摄入过多同样会干扰甲状腺的正常生理功能，导致甲状腺细胞代谢紊乱，也可能引发囊性结节的形成。
三、自身免疫因素
自身免疫性甲状腺疾病，如桥本甲状腺炎，可引起甲状腺组织的免疫损伤。免疫系统攻击甲状腺细胞，导致滤泡结构破坏、功能异常，进而使液体在滤泡内潴留形成囊性结节。这类患者体内存在针对甲状腺抗原的自身抗体，如甲状腺过氧化物酶抗体等，持续的免疫炎症反应是囊性结节形成的重要诱因。
四、电离辐射暴露
儿童期颈部接受过电离辐射（如医疗辐射、核辐射等），会损伤甲状腺细胞的DNA，影响其正常增殖与分化，增加甲状腺囊性结节的发病风险。研究表明，颈部电离辐射暴露史是甲状腺囊性结节的独立危险因素之一。
五、内分泌紊乱
1.雌激素水平变化：女性在青春期、孕期、围绝经期等雌激素波动较大的阶段，雌激素可能影响甲状腺细胞的生长调控，导致甲状腺滤泡出现囊性改变。例如，孕期女性由于体内雌激素水平显著升高，甲状腺功能状态改变，囊性结节的发生率可能相对升高。
2.其他激素失衡：甲状腺轴相关激素（如促甲状腺激素等）的异常也可能参与甲状腺囊性结节的形成，激素失衡会干扰甲状腺的正常生理过程，促使囊性结构的出现。
六、炎症因素
甲状腺局部的慢性炎症，如长期存在的甲状腺炎（非自身免疫性炎症）反复刺激甲状腺组织，可导致滤泡壁受损、通透性改变，使得液体在滤泡内积聚，逐渐形成囊性结节。炎症过程中释放的炎性介质会进一步加重甲状腺组织的损伤与结构异常。