霉菌性尿道炎主要是由白色念珠菌等真菌感染引起，治疗一般需要使用抗真菌药物。通常可以选用氟康唑等药物来进行治疗，一般规范治疗后多数患者能得到较好的疗效。
用什么抗真菌药治疗
氟康唑：属于三唑类抗真菌药物，能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，从而发挥抗真菌作用。它可以口服，对于霉菌性尿道炎有较好的疗效。伊曲康唑：也是常用的抗真菌药物，同样通过干扰真菌细胞色素P450的活性，影响其细胞膜合成来发挥作用，可用于霉菌性尿道炎的治疗。
治疗期间的生活注意事项
个人卫生：要保持尿道口清洁干燥，每天用清水清洗外阴部，清洗时要注意由前向后，避免将肛门处的细菌带到尿道口。避免性生活：在治疗霉菌性尿道炎期间应避免性生活，因为性生活可能会导致交叉感染，使病情加重或反复，一般建议治疗结束后复查真菌转阴后再恢复性生活。
特殊人群的治疗要点
女性患者：女性在月经期间更要注意外阴清洁，因为月经血是良好的培养基，容易滋生真菌。如果同时有霉菌性阴道炎，要积极治疗阴道炎，因为阴道炎可能会导致尿道炎反复发生。糖尿病患者：糖尿病患者由于血糖较高，容易合并霉菌性尿道炎，这类患者除了进行抗真菌治疗外，还需要积极控制血糖，将空腹血糖控制在7mmol/L左右，餐后血糖控制在10mmol/L左右，这样才能更好地治疗霉菌性尿道炎并防止复发。