胃食管反流的药物主要包括抑酸药、促胃肠动力药等。一般来说，抑酸药中的质子泵抑制剂是治疗胃食管反流常用的药物之一。
一、抑酸药
质子泵抑制剂：这类药物能有效抑制胃酸分泌，比如奥美拉唑，它可以特异性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌的最后步骤，从而减轻胃酸对食管黏膜的刺激，一般用药后能较快缓解胃食管反流引起的烧心、反酸等症状。H₂受体拮抗剂：像雷尼替丁，它能选择性竞争结合组胺H₂受体，使胃酸分泌减少，对轻至中度胃食管反流有一定的治疗作用，但相对质子泵抑制剂，抑酸作用稍弱一些。
二、促胃肠动力药
多巴胺受体拮抗剂：多潘立酮属于此类药物，它能促进胃肠蠕动，增强食管下括约肌张力，加快胃排空，从而减少胃内容物反流到食管的机会。不过，老年人使用时要注意可能存在的心脏方面的风险，需谨慎。5-羟色胺受体激动剂：莫沙必利也是促胃肠动力药，它可以通过兴奋胃肠道胆碱能中间神经元及肌间神经丛的5-羟色胺受体，促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠道运动，改善胃食管反流患者的症状，但也有个别患者可能会出现腹泻等不良反应。
三、黏膜保护剂
铝碳酸镁：它可以中和胃酸，还能在食管、胃黏膜表面形成保护膜，减轻胃酸、胆汁等对黏膜的损伤，缓解胃食管反流引起的不适症状，比如胃痛、烧心等。而且它起效相对较快，服用方便。硫糖铝：该药能在溃疡面或炎症处形成一层保护膜，保护胃黏膜免受胃酸的侵蚀，对胃食管反流导致的食管黏膜损伤有一定的保护作用，但可能会引起便秘等不良反应。