龟头小可能由多种原因导致。一般来说，男性阴茎在疲软状态下长度约为4~8厘米，勃起后约8~18厘米，如果龟头尺寸在正常范围内但自认为偏小，可能与心理因素有关。
先天发育因素
遗传基因影响： 男性的生殖器官发育受遗传基因调控，如果家族中的男性普遍存在龟头相对偏小的情况，可能是遗传因素导致。例如某些遗传性综合征可能会影响生殖器官的正常发育，进而表现为龟头小。胚胎发育阶段异常： 在胚胎发育过程中，如果受到一些不利因素影响，如母体在孕期接触某些致畸物质、患有某些疾病等，可能干扰生殖器官的正常分化和发育，导致出生后龟头相对较小。
内分泌因素
雄激素水平偏低： 雄激素对男性生殖器官的发育起着重要作用。如果男性在青春期前雄激素分泌不足，会影响阴茎包括龟头的正常发育，导致龟头相对较小。一般来说，正常青春期男性体内雄激素水平有一定的正常范围，若低于此范围就可能出现影响。内分泌疾病影响： 像垂体疾病、甲状腺疾病等内分泌疾病可能会间接影响雄激素的分泌和作用，从而干扰龟头的正常发育。例如垂体瘤可能导致促性腺激素分泌异常，进而影响生殖器官发育。
疾病因素
阴茎炎症： 长期的阴茎炎症可能会影响龟头的正常发育和外观。例如慢性龟头炎，如果没有得到及时有效的治疗，炎症长期刺激可能导致龟头组织增生、粘连等情况，从视觉上可能给人龟头偏小的感觉。而且炎症持续存在可能会影响局部的血液循环和营养供应，对发育产生不利影响。包皮过长或包茎： 包皮过长或包茎如果没有及时处理，可能会限制龟头的正常发育。因为过长的包皮包裹着龟头，阻碍了龟头与外界的正常摩擦等刺激，影响其正常生长。长期的包皮过长或包茎还可能增加感染风险，进一步影响生殖器官健康。