毛囊炎主要是由细菌等病原体感染毛囊引起的。比如金黄色葡萄球菌就常是引发毛囊炎的常见致病菌，约有50% - 70%的毛囊炎是由它导致的。
细菌感染引发
金黄色葡萄球菌感染： 金黄色葡萄球菌是一种常见的细菌，它容易黏附在皮肤表面的毛囊处。当皮肤有微小破损时，比如被指甲轻微划伤、蚊虫叮咬后搔抓导致皮肤破损等，金黄色葡萄球菌就容易侵入毛囊，引发炎症反应，从而导致毛囊炎。表皮葡萄球菌感染： 表皮葡萄球菌也是皮肤表面的常驻菌，在皮肤屏障功能受损时，它也可能感染毛囊，引起毛囊炎。一般来说，皮肤卫生状况差、长期处于潮湿环境等情况，会增加表皮葡萄球菌感染毛囊引发毛囊炎的风险。
真菌感染相关
马拉色菌感染： 马拉色菌是一种嗜脂性真菌，在油性皮肤的人群中更容易繁殖。比如青春期皮脂腺分泌旺盛，皮肤油脂多，为马拉色菌提供了良好的生长环境，马拉色菌就会感染毛囊，引发马拉色菌性毛囊炎。通常油性皮肤的人患这类毛囊炎的概率相对较高。其他真菌： 像念珠菌等真菌也可能引起毛囊炎，不过相对来说不如金黄色葡萄球菌和马拉色菌常见。当人体免疫力低下时，或者长期使用抗生素、糖皮质激素等情况，可能会导致真菌失衡，从而引发念珠菌等真菌感染毛囊导致毛囊炎。
机体自身因素影响
免疫力低下： 当人体的免疫力下降时，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病，或者长期熬夜、过度劳累等，身体抵御病原体的能力减弱，就更容易受到细菌或真菌等病原体的侵袭，进而引发毛囊炎。例如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，机体抵抗力下降，发生毛囊炎的几率比正常人要高很多。毛发因素： 毛发过度牵拉也可能引发毛囊炎。比如经常扎很紧的马尾辫、小辫子，或者从事需要频繁摩擦毛发的工作，像军人长时间戴头盔等，都可能使毛囊受到牵拉损伤，从而增加毛囊炎的发生风险。尤其是头发长期被牵拉的部位，更容易出现毛囊炎。