怀孕40天不想要孩子，可根据自身情况选择以下处理方式：
1.药物流产：怀孕49天内可选择药流，是通过服用药物终止妊娠。药流的成功率较高，但可能会出现药流不全，需要进行清宫手术。药流后要注意休息，避免劳累，同时要注意观察阴道出血情况，如出血量多或出血时间长，应及时就医。
2.人工流产：怀孕10周内可选择人工流产，包括负压吸引术和钳刮术。负压吸引术适用于妊娠10周内，手术时间短，出血少，但可能会出现子宫穿孔等并发症。钳刮术适用于妊娠11-14周，手术时间长，出血多，对子宫的损伤较大。人工流产前需要进行一系列的检查，如血常规、白带常规、B超等，以确保手术的安全性。
3.其他：如果怀孕40天不想要孩子，还可以选择超导可视人流、宫腔镜取胚术等方式。这些方式对子宫的损伤较小，但费用相对较高。
需要注意的是，无论选择哪种方式，都需要在医生的指导下进行。同时，流产后要注意休息，加强营养，保持外阴清洁，避免性生活和盆浴一个月。此外，流产对身体有一定的伤害，可能会导致月经失调、感染、宫腔粘连等并发症。因此，在性生活中应做好避孕措施，避免意外怀孕。