怀孕13周小腹隐隐作痛可能由以下原因导致：子宫增大、子宫收缩、胃肠道功能不好。
一、子宫增大：
1.在怀孕13周时，子宫会逐渐开始增大，这会对周围组织产生牵拉和压迫。
2.此时可能会出现下腹部隐痛的状况，这种疼痛通常没有规律，只是偶尔会感觉有些不适。
3.一般无需进行特殊治疗，建议孕妇注意休息，避免高强度的体力活动。
二、子宫收缩：
1.此时胎儿在宫腔内已形成明显的人体结构且有羊水，胎儿在宫腔内的活动会对子宫产生刺激，引起轻微的子宫收缩，表现为小腹隐隐作痛，这是正常现象，孕妇不用过度担忧。
2.但如果除了小腹隐痛外，还伴有腰骶部不适、阴道异常出血等情况，可能是先兆流产。
3.孕妇要卧床休息，禁止性生活，遵医嘱适当补充维生素E、叶酸等。对于黄体功能不足导致的先兆流产，可在医生指导下注射或口服黄体酮进行保胎。
三、胃肠道功能不好：
1.怀孕13周时的小腹隐隐作痛也可能是由于胃肠道功能不佳引起。
2.胃肠道功能不好会导致消化不良、胀气、肠痉挛或胃痉挛等情况，从而出现小腹隐隐作痛。
3.这种情况多与饮食有关，可能是进食了寒凉、辛辣食物所刺激导致。孕妇处于特殊时期，一般不建议使用药物治疗，可先通过饮食调整，要注意避免食用辛辣刺激、生冷、过硬的食物，饮食应清淡、易消化，比如可以喝粥、吃面条等。若长时间症状不缓解，要及时就医，在医生指导下用药，不可自行用药以免影响胎儿健康。
总之，怀孕13周小腹隐隐作痛可能有多种原因，需要根据具体情况进行分析和处理。孕妇若有相关症状应密切关注，必要时寻求医生帮助。