附件囊肿的治疗需根据囊肿的大小、性质等情况来定。一般直径小于5厘米且无明显症状的附件囊肿，可先观察，每3~6个月复查超声，了解囊肿变化情况。
观察随访情况
小囊肿定期复查： 对于直径小于5厘米的附件囊肿，若超声提示为单纯性囊肿，无恶变征象，可选择每3个月复查一次B超，观察囊肿大小变化。比如一些生理性的滤泡囊肿或黄体囊肿，有可能会自行消失。持续关注变化： 在观察期间，如果囊肿没有增大，甚至缩小或消失，通常不需要特殊治疗。但如果囊肿持续存在或有增大趋势，就需要进一步处理。
药物治疗情况
炎症相关囊肿用药： 如果附件囊肿是由炎症引起的，如输卵管卵巢炎性包块，可能会使用抗生素治疗。比如盆腔炎性疾病导致的附件炎性囊肿，会根据病情选用合适的抗生素，像头孢类联合甲硝唑等药物来控制炎症，从而使囊肿缩小。但药物治疗需要在医生指导下规范使用。内分泌相关囊肿调节： 对于一些因内分泌失调引起的附件囊肿，如多囊卵巢综合征患者可能出现的附件囊肿，可能会用到调节内分泌的药物，不过这类药物的使用比较复杂，需要医生根据具体内分泌情况来制定方案。
手术治疗情况
手术指征明确： 当附件囊肿直径大于5厘米，或者怀疑囊肿有恶变可能，又或者囊肿引起腹痛等症状时，通常需要手术治疗。手术方式有多种，比如腹腔镜手术，这种手术创伤小，恢复快。对于年轻有生育需求的患者，会尽量保留卵巢功能；而对于年龄较大、无生育需求且囊肿有恶变倾向的患者，可能会行附件切除术等。术后注意事项： 手术后需要注意休息，一般建议休息1~2周，同时要注意伤口的护理，防止感染。并且术后也需要定期复查，因为有复发的可能。