口腔溃疡的发生是多种因素综合作用的结果，比如大约有20% - 30%的人有遗传倾向，如果家族中有多人经常长口腔溃疡，那么其他人患口腔溃疡的几率相对较高。
一、局部创伤因素
口腔内咬伤： 比如吃饭时不小心咬到口腔黏膜，就可能引发口腔溃疡，这种情况在牙齿排列不整齐或者咀嚼速度过快的人群中较为常见。尖锐牙尖刺激： 口腔里如果有比较尖锐的牙尖，长期摩擦周围的黏膜组织，也会导致口腔溃疡的出现，这种情况一般能发现对应的尖锐牙体组织。
二、免疫系统因素
免疫力下降时易发病： 当人体免疫力降低时，比如感冒发烧、过度疲劳、睡眠严重不足等情况下，身体的免疫监视功能减弱，就容易让原本潜伏在口腔内的病毒或细菌活跃起来，从而引发口腔溃疡。一般来说，当连续熬夜超过2 - 3天，或者感冒持续1周左右，就可能增加口腔溃疡的发生概率。自身免疫性疾病关联： 像白塞病这类自身免疫性疾病，口腔溃疡是其常见的症状之一，患者往往还会伴有眼部病变、生殖器溃疡等表现。
三、营养缺乏因素
维生素缺乏： 缺乏维生素B族，尤其是维生素B2、B6等，会影响口腔黏膜的正常代谢，导致黏膜抵抗力下降，容易长口腔溃疡。一般成年人每天需要摄入维生素B2约1.2 - 1.5毫克，维生素B6约1.2 - 1.5毫克，如果长期饮食不均衡，挑食、偏食，就容易缺乏这些维生素。微量元素缺乏： 锌、铁等微量元素缺乏也和口腔溃疡有关。比如锌参与人体很多重要的生理活动，缺乏锌时，会影响细胞的正常分裂和修复，导致口腔黏膜修复能力下降，引发口腔溃疡。一般正常成年人每天锌的摄入量建议是10 - 15毫克，铁的摄入量男性为15毫克左右，女性为20毫克左右，长期摄入不足就可能出现缺乏情况。