精子形态正常参考值需大于等于4%，即畸形率参考值应小于96%。若畸形精子百分率高于96%，就被称作畸形精子症，会引发不育。对于精子畸形率高可分类如下治疗：
一、因泌尿生殖道感染、腮腺炎并发睾丸炎、附睾结核等导致的，可展开抗炎治疗。比如，一些泌尿系统感染可能会影响精子质量，引发畸形率升高，此时进行针对性的抗炎治疗就显得很重要。
二、由精索静脉曲张引起的可考虑手术。因为精索静脉曲张会对精子产生不良影响，通过手术治疗有可能改善这种状况。
三、若因使用激素或某些化学药物如抗癌药、利血平、呋喃类等造成精子发育不成熟，可考虑避免使用此类药物。毕竟这些药物可能干扰精子的正常发育过程。
四、生殖腺受放射线照射引起精子突变的，应避免或减少射线接触。放射线的危害不可小觑，它可能对生殖腺和精子带来严重影响。
五、因阴囊局部长期高热、长期酗酒（特别是高浓度烈性酒）致精子畸变，生活中要注意避免局部长期高热，勤换内裤，戒烟忌酒。局部高温和过度饮酒都可能对精子造成损害。
六、畸形精子若超过70%，则要进行染色体检查，若有染色体病，治疗会很困难。这凸显了对严重畸形精子情况进行深入检查的重要性。
七、日常生活中要保持良好生活习惯及作息规律，加强运动，增强体质。良好的生活方式对于维持精子健康有着积极意义。
总之，具体治疗应依据导致畸形精子的原因，消除不利因素（药物、放射线、高温、酒、烟、化妆品等），针对病因进行治疗。若是由生殖道感染引起，可进行抗炎治疗；对精索静脉曲张者，可考虑手术；畸形精子超过70%，则应进行染色体检查。同时日常生活中要注重保持良好习惯和规律作息，加强锻炼以增强体质。