头上长毛囊炎可以通过一般治疗、局部药物治疗、系统药物治疗等方法来改善，一般经过规范处理，多数能在数天到数周内缓解。
一般治疗：保持清洁与生活习惯调整
保持头部清洁是关键，建议每天用温和的洗发水清洗头部，但要注意避免过度清洁，以免损伤头皮。同时，要保证充足的睡眠，一般成年人每天需要7-8小时的睡眠时间，良好的睡眠有助于提高身体免疫力，促进毛囊炎恢复。还要注意饮食均衡，多吃新鲜的蔬菜和水果，减少辛辣、油腻、甜食等刺激性食物的摄入，比如尽量少吃辣椒、油炸食品、蛋糕等。另外，要避免搔抓、挤压头部的毛囊炎部位，防止炎症扩散。
局部药物治疗：根据病情选择合适外用药
抗生素类外用药：
如果是细菌感染引起的毛囊炎，可使用莫匹罗星软膏，它对多种革兰阳性菌有抗菌作用，能抑制细菌的蛋白质合成，从而发挥杀菌作用。还有夫西地酸乳膏，对引起毛囊炎的常见细菌如金黄色葡萄球菌等有较好的抗菌活性，能涂抹在患处，一天使用数次。
抗真菌类外用药：
若是真菌感染导致的毛囊炎，像酮康唑乳膏就可以使用，它能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响真菌的代谢，起到抗真菌的效果。还有联苯苄唑乳膏，也可用于治疗真菌感染引起的头部毛囊炎，涂抹后能在皮肤表面形成一层药物膜，持续发挥抗真菌作用。
系统药物治疗：严重情况需口服药物
细菌感染严重时：
当头部毛囊炎比较严重，伴有发热等全身症状时，可能需要口服抗生素。比如头孢类抗生素，如头孢呋辛酯，它是第二代头孢菌素，对多种细菌有抗菌活性，能通过抑制细菌细胞壁的合成来发挥杀菌作用，但使用前需要确认患者没有头孢类药物过敏史。
真菌感染顽固时：
如果是真菌感染顽固的情况，可能需要口服抗真菌药物，像伊曲康唑，它可以抑制真菌细胞色素P450酶系统，影响真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用，但服用伊曲康唑期间需要定期监测肝功能，因为它可能对肝脏有一定影响。