怀孕三个月肚子疼，有正常现象，也有病理性原因，如先兆流产、盆腔炎等。具体如下：
一、正常表现：怀孕后，胚胎不断生长发育，子宫腔内容积逐渐变大，膨大的子宫会对腹壁产生一定压迫，从而可能引发肚子疼。
二、先兆流产：怀孕三个月时，孕妇若受到强烈精神刺激或腹部遭受外力撞击，可能诱发子宫收缩，导致先兆流产，使孕妇出现肚子疼痛，还常伴有阴道流血、腰骶部酸痛等症状。
1.精神刺激：比如突然遭遇重大变故等可能带来剧烈的精神波动。
2.外力撞击：如不小心受到碰撞等情况。
三、盆腔炎：怀孕三个月时，如果孕妇身体免疫功能降低，细菌等病原体进入盆腔，会引起盆腔组织出现炎性病变，导致孕妇肚子疼，同时可能伴有分泌物增多、有异味、发热、寒战、倦怠、疲乏等症状。
1.免疫功能下降：孕期身体状态改变可能导致免疫力不如以往。
2.病原体入侵：细菌等有机会趁虚而入。
总之，引起孕妇三个月肚子疼的原因较多，需要在专业医生指导下，依据具体病因进行治疗。