脂肪肝可能引发多种健康问题，若不及时干预，会对身体造成多方面不良影响。
一、进展为肝硬化
部分脂肪肝患者病情会逐渐进展，有可能发展为肝硬化。长期的肝脏脂肪堆积会持续损伤肝细胞，导致肝脏纤维组织增生，影响肝脏正常结构和功能，增加肝硬化的发生风险，这一过程可能历经数年甚至更长时间，与患者的生活方式、基础疾病等因素相关。
二、增加肝癌风险
脂肪肝是肝癌的危险因素之一。肝脏长期受脂肪浸润，细胞代谢等功能紊乱，基因可能发生异常改变，进而增加癌变几率。有脂肪肝基础的人群相较于常人，患肝癌的可能性会有所升高，这与脂肪对肝脏持续的刺激以及肝脏微环境的改变等有关。
三、影响代谢功能
脂肪肝常伴随代谢紊乱，如血糖、血脂异常等。肝脏是代谢的重要器官，脂肪堆积会干扰肝脏正常的糖代谢、脂代谢等，易引发胰岛素抵抗，使血糖难以维持正常水平，同时也会导致血脂升高，进一步增加心血管疾病等的发生风险，不同年龄、性别人群若有脂肪肝且代谢紊乱，受影响程度可能因个体差异而不同，但都会对整体健康产生不利影响。
四、损害肝脏功能
脂肪肝会使肝脏的正常结构和功能受损，影响其解毒、合成等多种功能。肝脏无法正常发挥作用，会导致体内毒素堆积、蛋白质等合成减少等，影响身体各系统的正常运转，对于不同生活方式的人，如长期高脂高糖饮食、缺乏运动者，脂肪肝对肝脏功能的损害可能更为明显，而有基础病史的人群可能会加重原有病情的发展。